Les pilotes militaires sont formés par leur armée d'appartenance, leur formation intégrant d'une part les spécificités liées à leur appartenance à une armée (école d'officier généralement) et d'autre part celles liées à leurs avions et missions (maîtrise du système d'arme, entraînement au tir, etc...).
Dans le cas d'un pilote d'avion de chasse, la formation comprend:
- une formation de base, avec pratique sur avion monomoteur à hélice
- une formation avancée, avec pratique sur avion d'entraînement à réaction
- une formation finale sur une version d'entraînement d'un avion de chasse réel
Une partie de cette formation se déroule sur simulateur de vol. Elle inclut d'office certaines qualifications comme le vol de nuit ou le vol aux instruments. Pour les pilotes d'une aéronavale, il faut rajouter la qualification porte-avions.
Les pilotes militaires doivent effectuer un nombre minimal d'heures de vol par an pour conserver leurs qualifications et doivent renouveler régulièrement leur qualification de vol aux instruments (IFR).